Đầu tháng 9/2017, Tổng Cục thuế ban hành Công văn 3978/TCT-KK hướng dẫn về xử lý hoàn thuế giá trị gia tăng. Theo đó, trong quá trình giải quyết hồ sơ hoàn thuế, cơ quan Thuế xác định số thuế đủ điều kiện được hoàn một phần và một phần chưa đủ điều kiện hoàn cần thanh tra, kiểm tra hoặc chờ kết quả xác minh làm rõ thì: – Đối với số thuế đã đủ điều kiện hoàn: Cơ quan thuế giải quyết ngay và cập nhật đầy đủ vào ứng dụng TMS. – Đối với số thuế chưa đủ điều kiện hoàn cần thanh tra, kiểm tra lại hoặc chờ kết quả xác minh, hướng dẫn: Lưu tại cột “Số hoàn cần xem xét” trên ứng dụng TMS. Sau khi có kết quả thanh tra, kiểm tra hoặc kết quả xác minh nếu đủ điều kiện hoàn: Cơ quan Thuế tự tạo hồ sơ đề nghị hoàn, cập nhật hồ sơ gốc của người nộp thuế và tiếp theo, thực hiện xử lý hoàn thuế vào ứng dụng TMS theo quy định. Xem nội dung chi tiết tại Công văn 3978/TCT-KK ngày 05/9/2017.
